Храм в честь Сошествия Святого Духа на апостолов  был основан двумя сестрами Феодорой и Анной Волович на их земельном участке в конце XVI века. Вскоре при нем был основан монастырь. После того, как в 1609 году Свято-Троицкая церковь была отдана униатам, собор Святого Духа стал центром православия Литвы. При нем действовало православное братство, училище и типография. В течении неспокойного XVII века церковь несколько раз горела, но была восстановлена на средства царя Петра I. В середине XVIII века она была перестроена по проекту одного из самых знаменитых представителей школы вильнюсского барокко Кристофора Глаубица. Здание стало представлять собой смесь католического и православного архитектурных стилей. Оно в форме латинского креста, с двумя барочными башенками на переднем фасаде. Стены церкви украшены рельефами из стюка. Иконостас поделен на три яруса волнистыми карнизами, украшен колоннами и скульптурами и похож на католический алтарь.

В середине XIX века в подземельях церкви были найдены нетленные мощи виленских мучеников Антония, Иоанна и Евстафия. Они жили при литовском князе Альгирдасе в середине XIV века, приняли христианство и стали открыто исповедовать его среди язычников. Естественно, их посадили в темницу, мучили и убили. Мученики причислены к лику святых и почитаются всей православной церковью.

И в наши дни собор Святого Духа – это центр православия Литвы, самая популярная церковь Вильнюса. При монастыре организовано заочное обучение в московском Свято-Тихоновском институте, работает большая библиотека.

Список достопримечательностей:
Кафедра, Костел св. Анны, Университет, Ратуша, Башня Гедиминаса, Аушрос Вартай,Костел Петра и Павла, Костел св. Казимира, Костел св. Михаила, Костел св. Терезы, Костел св. Николая, Костел Миссионеров, Президентура, Церковь Святого Духа, Церковь Успения Пречистой Богородицы, Церковь св. Николая, Церковь св. Параскевы